A Danganronpa először PSP-n jelent meg visual novel-ként. A történet főhőse Makoto Naegi, aki épp készül megkezdeni tanulmányait a Hope’s Peak Academy-n. Ez egy iskola kiemelkedő képességekkel rendelkező tanulók számára. Hogy Naegi miben kiemelkedő? Mint rögtön a történet elején kiderül, semmiben. Szerencséjére (vagy ahogy később kiderül, pechére) sikerül mégis felvételt nyernie, azonban a boldog iskolaévek helyett már a kapun belépve rá kell döbbennie, hogy alighanem valami gubanc van az iskola berkein belül. Amint belép, rögtön elveszti az eszméletét. Egy befalazott ablakú osztályteremben ébred, ahonnan egy üzenet utasítását követve eljut a tornaterembe, ahol találkozik az iskolában tartózkodó többi “diákkal”.